Finansministeriet og CO10 – Centralorganisationen af 2010 har indgået organisationsaftale for visse operative medarbejdere og ledere i Naviair. Organisationsaftalen omfatter flyvelederassistentaspiranter, flyvelederassistenter, apron tower flyveledere, information flyveledere, simulatoroperatører, teamchefer, ledere og chefer i Naviair.